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技術(shù)文章

SCIEX試劑在代謝組學(xué)研究中的創(chuàng)新應(yīng)用

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  代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,致力于研究生物體或組織中所有小分子代謝物的變化規(guī)律。在代謝組學(xué)研究的征程中,先進(jìn)的技術(shù)和試劑猶如閃耀的星辰,照亮前行的道路。SCIEX試劑憑借其性能,在代謝組學(xué)研究中展現(xiàn)出了諸多創(chuàng)新應(yīng)用,為科研工作者帶來(lái)了新的研究視角和突破。
  高覆蓋靶向代謝組學(xué)的革新
  高覆蓋靶向代謝組學(xué)是當(dāng)下代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)室積極探索的前沿領(lǐng)域。SCIEX試劑在這一領(lǐng)域大放異彩,以其優(yōu)勢(shì)推動(dòng)著研究的深入發(fā)展。例如,在對(duì)紫薯的研究中,利用SCIEX QTRAP®系統(tǒng),結(jié)合SCIEX TripleTOF™系統(tǒng)的高覆蓋特性,構(gòu)建了一套高效的研究方案。首先,在SCIEX TripleTOF™系統(tǒng)上運(yùn)用IDA方法對(duì)紫薯提取物進(jìn)行高覆蓋度測(cè)定,隨后將鑒定出的化合物構(gòu)建MRM離子對(duì),再借助SCIEX QTRAP®系統(tǒng)開(kāi)展靶向代謝組學(xué)測(cè)定。通過(guò)這流程,成功檢測(cè)出紫薯中的203種代謝物,涵蓋氨基酸、核苷、糖類(lèi)、脂質(zhì)、黃酮及黃酮苷類(lèi)、花青素類(lèi)、酚酸類(lèi)等多種成分。該方法靈敏度很高,檢測(cè)速度快,化合物覆蓋度廣,且特異性良好,正負(fù)切換同時(shí)檢測(cè)功能結(jié)合Scheduled MRM™功能,僅需35分鐘即可完成一針樣品中203個(gè)化合物的檢測(cè),大大提高了檢測(cè)效率。同時(shí),QC樣本中91%化合物的RSD在15%之內(nèi),充分證明了儀器和方法的出色重現(xiàn)性。
  助力非靶向與靶向結(jié)合的代謝組學(xué)研究
  代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的復(fù)雜性使得某些特征峰的鑒定面臨挑戰(zhàn),而SCIEX試劑在非靶向和發(fā)現(xiàn)代謝組學(xué)解決方案中展現(xiàn)出其價(jià)值。其側(cè)重于采用現(xiàn)代方法,如SWATH®采集方法,結(jié)合全面的統(tǒng)計(jì)手段以及合作伙伴開(kāi)發(fā)的工具,通過(guò)數(shù)據(jù)簡(jiǎn)化和去卷積鑒定相關(guān)代謝物,生成包含大量可重現(xiàn)代謝物信息的全面數(shù)據(jù)。例如,在組學(xué)覆蓋度不受影響的前提下,將全面的數(shù)據(jù)采集策略與先進(jìn)的數(shù)據(jù)處理流程相結(jié)合,對(duì)采集的數(shù)據(jù)進(jìn)行去卷積,顯著提高了發(fā)現(xiàn)全新生物相關(guān)差異代謝物的可能性。同時(shí),SCIEX的相關(guān)軟件,如XCMSPlus提供先進(jìn)的統(tǒng)計(jì)式一遍過(guò)數(shù)據(jù)處理功能,幫助科研人員找到重要的化合物并進(jìn)行鑒定和確證;LibraryView™軟件則可創(chuàng)建、管理MSMS譜庫(kù),為代謝物的鑒定提供有力支持。在實(shí)際研究中,如針對(duì)2型糖尿病的研究,借助SCIEX ZenoTOF 7600高分辨系統(tǒng)搭載的Zeno™trap離子阱技術(shù),開(kāi)發(fā)出HRMS-MRM MS模式新方法,一次進(jìn)樣便能同步分析非靶向代謝組和靶向暴露組,極大地簡(jiǎn)化了代謝組-暴露組全關(guān)聯(lián)研究(mEWAS)的流程,且在代謝物和外源性化合物的定性和定量能力上有顯著提升。
  在農(nóng)業(yè)分子育種中的創(chuàng)新實(shí)踐
  分子育種旨在通過(guò)現(xiàn)代生物學(xué)技術(shù)精準(zhǔn)改變植物遺傳信息,培育優(yōu)良性狀品種。代謝組學(xué)在此過(guò)程中發(fā)揮著關(guān)鍵作用,SCIEX試劑為其提供了強(qiáng)大助力。針對(duì)小麥、水稻、玉米、番茄等多種作物,SCIEX開(kāi)發(fā)了一系列代謝組學(xué)和脂質(zhì)組學(xué)解決方案。以小麥和水稻為例,其提供的靶向分析方案專(zhuān)屬性強(qiáng)、靈敏度高、穩(wěn)定性好,能夠有效區(qū)分不同品種。在玉米研究中,通過(guò)非靶向代謝組學(xué)分析,鑒定出330個(gè)代謝物,清晰揭示了不同品種玉米間代謝物的明顯差異;非靶向脂質(zhì)組學(xué)方法也鑒定出大量脂質(zhì)成分,并篩選出眾多差異脂質(zhì)類(lèi)別。此外,針對(duì)擬南芥和番茄等模式植物的廣靶代謝組分析方案,鑒定出豐富的代謝物,為作物品質(zhì)改良和植物代謝生物學(xué)研究積累了寶貴知識(shí)和資源。同時(shí),在植物激素、類(lèi)胡蘿卜素等功能性成分的精準(zhǔn)定量方面,SCIEX液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜法展現(xiàn)出高靈敏度、抗基質(zhì)干擾等優(yōu)勢(shì),滿足了復(fù)雜植物基質(zhì)中低含量成分的檢測(cè)需求,為植物生長(zhǎng)發(fā)育和應(yīng)對(duì)脅迫等研究提供了重要支持。

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